Значительные трудности возникли при обсуждении границ Польши. В Ялте Рузвельт выступил за то, чтобы в составе Польши остались Львов и Львовская область. Американская и английская делегации пытались также доказать, что Польше не должны быть возвращены ее исконные западные земли. Рузвельт предложил, чтобы в коммюнике об итогах конференции ничего не говорилось о польских границах. Советская делегация предлагала установить западную границу Польши по Одеру и Западной Нейссе, а восточную — по «линии Керзона», как это и было обусловлено ранее. Настойчивая защита советской делегацией коренных интересов Польши увенчалась успехом. Главы правительств приняли такое решение о польских границах: «Восточная граница Польши должна идти вдоль линии Керзона с отступлением от нее в некоторых районах от пяти до восьми километров в пользу Польши. Главы трех Правительств признают, что Польша должна получить существенное приращение территории на севере и на западе. Они считают, что по вопросу о размере этих приращений в надлежащее время будет спрошено мнение нового Польского Правительства Национального Единства и что, вслед за тем, окончательное определение западной границы Польши будет отложено до мирной конференции».
На конференции был рассмотрен вопрос об объединении демократических сил в Югославии. Главы трех правительств рекомендовали Тито и Шубашичу немедленно ввести в действие соглашение, подписанное Тито и Шубашичем в ноябре 1944 года, и создать на его основе новое правительство. Антифашистское вече национального освобождения должно было быть расширено за счет включения в него членов последней югославской скупщины, которые не скомпрометировали себя сотрудничеством с гитлеровцами. Новый орган должен был стать временным парламентом страны.
Важное место в работе конференции в Ялте заняло_обсуждение вопросов Дальнего Востока. К началу 1945 года американское и английское правительства с пессимизмом смотрели на перспективы войны на Тихом океане. По мере приближения войны к Японским островам сопротивление становилось все более ожесточенным. В Вашингтоне и Лондоне прекрасно знали, что нанесение окончательного поражения Японии потребует огромных жертв. Черчилль оценивал возможные потери американо-английских войск во время вторжения на Японские острова в 1,5 млн. человек, американские штабы — не менее 1 млн. В связи с обнаружившимися трудностями в военных операциях против Японии Объединенный комитет начальников штабов докладывал Рузвельту и Черчиллю: «Мы рекомендуем, чтобы для планирования даты окончания войны против Японии был принят срок— 18 месяцев после поражения Германии». Таким образом, если на первой Квебекской конференции считалось, что война против Японии закончится через 12 месяцев после капитуляции Германии, то в Ялте этот срок был продлен до 18 месяцев.
Советское правительство на конференции в Ялте подтвердило свое обещание вступить в войну против Японии, данное в Тегеране. Главы правительств СССР, США и Англии 11 февраля 1945 г. подписали секретное соглашение по вопросам Дальнего Востока. В нем говорилось: «Через два-три месяца после капитуляции Германии и окончания войны в Европе Советский Союз вступит в войну против Японии на стороне Союзников». Условия вступления СССР в войну на Дальнем Востоке были следующие: 1) сохранение статус-кво Внешней Монголии (Монгольской Народной Республики); 2) восстановление принадлежавших России прав, нарушенных вероломным нападением Японии в 1904 году, а именно: а) возвращение СССР Южного Сахалина и всех прилегающих к нему островов, б) интернационализация порта Дайрена с обеспечением преимущественных интересов СССР в этом порту и восстановление аренды на Порт-Артур как военно-морскую базу СССР, в) совместная с Китаем эксплуатация Китайско-Восточной и Южно-Маньчжурской железных дорог, дающих выход на Дайрен; 3) передача Советскому Союзу Курильских островов. США брали на себя получение согласия Китая относительно Внешней Монголии, упомянутых портов и железных дорог. Со своей стороны СССР выразил готовность заключить пакт о дружбе и союзе с Китаем и оказать ему помощь в целях освобождения от японского ига.